Nanoarchaeum equitans
Nanoarchaeum equitans | |
---|---|
Dve Nanoarchaeum equitans celici (in njun večji gostitelj Ignicoccus) | |
Znanstvena klasifikacija | |
Domena: | Archaea (arheje) |
Naddeblo: | DPANN |
Deblo: | Nanoarchaeota (nanoarheje) |
Razred: | Nanoarchaeia (nanoarheje) |
Red: | Nanoarchaeales (nanoarheje) |
Družina: | Nanoarchaeaceae (nanoarheje) |
Rod: | Nanoarchaeum (nanoarchaeum equitans) |
Vrsta: | N. equitans
|
Dvočlensko ime | |
Nanoarchaeum equitans Huber et al. 2002
|
Nanoarchaeum equitans je vrsta morskih arhej, ki jo je odkril leta 2002 v hidrotermalnem izviru ob obali Islandije na grebenu Kolbeinsey Karl Stetter. Ta organizem je edini predstavnik rodu Nanoarchaeum in so ga predlagali kot prvo vrsto novega debla. Seve tega mikroba so našli tudi na subpolarnem srednjeoceanskem grebenu in v bazenu Obsidian v narodnem parku Yellowstone. Ker uspeva pri temperaturah okoli 80°C, ga uvrščamo med termofile. Najboljše pogoje za rast ima pri pH 6 in 2-odstotni slanosti. Zdi se, da je Nanoarchaeum obvezni simbiont arheje Ignicoccus – za preživetje mora biti v stiku s svojim gostiteljem. Sam ne more tvoriti lipidov, ampak jih pridobiva od gostitelja. Njegove celice so zelo majhne, premera le 400 nm, kar ga uvršča med najmanjše znane organizme in najmanjše znane arheje.
Genom N. equitans je sestavljen iz enega samega krožnega kromosoma, povprečna vsebnost GC pa znaša 31,6%. Manjkajo mu skoraj vsi geni, ki so potrebni za tvorbo aminokislin, nukleotidov, kofaktorjev in lipidov, vendar ima vse gene, ki so potrebni za popravilo in podvajanje DNK. V njegovem genomu so tudi geni za beljakovine, ki sodelujejo pri rekombinaciji, kar pomeni, da lahko izvaja homologno rekombinacijo.[1] Kar 95% njegove DNK kodira beljakovine ali stabilne RNA molekule.
N. equitans ima majhne izrastke, ki izhajajo iz njegove krožne strukture. Površina celice je prekrita s tanko plastjo v obliki mreže (sloj S), ki celici daje oporo in jo ščiti.
Glej tudi
[uredi | uredi kodo]Sklici
[uredi | uredi kodo]- ↑ Waters E, Hohn MJ, Ahel I, Graham DE, Adams MD, Barnstead M, Beeson KY, Bibbs L, Bolanos R, Keller M, Kretz K, Lin X, Mathur E, Ni J, Podar M, Richardson T, Sutton GG, Simon M, Soll D, Stetter KO, Short JM, Noordewier M (Oktober 2003). »The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism«. Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (22): 12984–8. doi:10.1073/pnas.1735403100. PMC 240731. PMID 14566062.
- Huber, Harald; in sod. (2002). »A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont«. Nature. 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. PMID 11986665. S2CID 4395094. (This paper represents the first discovery of Nanoarchaeum.)
- Waters, Elizabeth; in sod. (2003). »The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism«. PNAS. 100 (22): 12984–12988. Bibcode:2003PNAS..10012984W. doi:10.1073/pnas.1735403100. PMC 240731. PMID 14566062. (This paper describes the genome sequence of Nanoarchaeum.)
- Brochier, Celine; Gribaldo, S; Zivanovic, Y; Confalonieri, F; in sod. (2005). »Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales?«. Genome Biology. 6 (5): R42. doi:10.1186/gb-2005-6-5-r42. PMC 1175954. PMID 15892870. (Recent work suggesting that Nanoarchaeum is not a new phylum of archaea, but is a type of euryarchaeon.)
- Das, Sabyasachi; in sod. (2006). »Analysis of Nanoarchaeum equitans genome and proteome composition: indications for hyperthermophilic and parasitic adaptation«. BMC Genomics. 7: 186. doi:10.1186/1471-2164-7-186. PMC 1574309. PMID 16869956. (This paper describes the genome and proteome analysis of Nanoarchaeum.)
Nadaljnje branje
[uredi | uredi kodo]Di Giulio, Massimo (2013). »Is Nanoarchaeum equitans a paleokaryote?«. Journal of Biological Research: 83–88.